English (United Kingdom)

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/featured_content/oa?rat=en

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/highlighted_journal/

Global: Zendy Plus annual

Presents the access of premium content as premium feature

Premium Content

Presents the keyphrase highlighting as premium feature

Keyphrase Highlighting

Presents the summarisation as premium feature

Summarisation

Insights

Presents the pdf analysis as premium feature

PDF Analysis

Presents the zaia usage as premium feature

ZAIA

Global: Zendy Tools annual

Global: Zendy Free Plan

Global: Zendy Tools monthly

Global: Zendy Plus monthly

Objective: Microorganisms that cause lung infections in cystic fibrosis (CF) are initially colonized in the upper respiratory tract mucosa and then pass into the lungs. In this study, we aimed to determine the pathogens colonized in the upper respiratory tract and the evaluation of phenotypic changes observed in these bacteria in patients with cystic fibrosis. Methods: Between May 2016 and May 2017 the routine respiratory tract samples (throat swab or sputum) taken from the patients who were under follow-up with a previously diagnosed CF (Group I) or who were started to be followed up for a newly diagnosed CF (Group II) were evaluated in the Gaziantep University Şahinbey Research and Practice Hospital Pediatric Immunology and Allergy Outpatient Clinic. Conventional methods and Bruker MALDI BiotyperTM (Becton Dickinson, Sparks, MD, USA) automated system were used to identify bacteria. Results: 500 respiratory tract samples from 123 patients were evaluated in the study. In 218 (43.6%) of the samples, 232 different pathogenic bacteria was isolated. 96 (18.3%) Staphylococcus aureus and 62 (11.8%) Pseudomonas aeruginosa were found as the most frequently isolated microorganisms. Phenotypic differences were detected in 16 S. aureus isolates as small colony variants and 24 P. aeruginosa isolates as mucoid colony producers. All of the isolates with phenotypic differences were isolated from patients in Group II. Conclusions: In CF patients, depending on the prolongation of the disease duration, phenotypic changes misleading the immune system or escaping from it occur in bacteria that are colonize the respiratory tract. Detection of these changes may Özet Amaç: Kistik fibroz (KF)’da akciğer infeksiyonlarına neden olan mikroorganizmalar önce üst solunum yolu mukozasında kolonize olmakta, buradan akciğere geçmektedir. Bu çalışmada kistik fibrozlu hastalarda üst solunum yolunda kolonize olmuş patojenlerin saptanması ve bu bakterilerde gözlenen fenotipik değişikliklerin irdelenmesi amaçlandı. Yöntemler: Mayıs 2016-Mayıs 2017 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Uygulama ve Araştırma Hastanesi Çocuk İmmünolojisi ve Alerji Hastalıkları Polikliniğinden daha önce konulmuş KF tanısıyla takip edilmekte olan (Grup I) veya KF tanısı yeni konularak takip edilmeye başlanmış olan (Grup II) hastalardan alınan solunum yolu (boğaz sürüntüsü veya balgam) örnekleri değerlendirildi. Bakterilerin tanımlanmasında konvansiyonel yöntemler ve Bruker MALDI BiotyperTM (Becton Dickinson, Sparks, MD, ABD) otomatize sistemi kullanıldı. Bulgular: Çalışmada 123 hastaya ait 500 solunum yolu örneği değerlendirildi. Örneklerin 218 (%43.6)’inde 232 farklı patojen mikroorganizma izole edildi. 96 (%18.3) Staphylococcus aureus ve 62 (%11.8) Pseudomonas aeruginosa en sık izole edilen mikroorganizmalar olarak bulundu. 16 S. aureus izolatında, küçük koloni varyantı ve 24 P. aeruginosa izolatında ise mukoid koloni biçiminde fenotipik farklılık saptandı. Fenotipik farklılık saptanan izolatların tümü Grup II’de yer alan hastalardan izole edilmişti. Sonuçlar: KF hastalarında hastalık süresi uzadıkça solunum yollarında kolonize olan bakterilerde immün sistemi yanıltan ya da immün sistemden kaçmalarını sağlayan fenotipik değişiklikler meydana gelmektedir. Bu değişikliklerin saptanması Özgün Araştırma / Original Article

Evaluation of Phenotypic Characteristics of Microorganisms Isolated From Respiratory Tract of the Patients With Cystic Fibrosis