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Resume : Une nouvelle methode d’etude in situ du phytoplancton (THYSSEN et al., 2008a) a ete elaboree pour etudier la variabilite a court terme et l’heterogeneite spatiale de la distribution du phytoplancton marin. Cette approche emergente utilise un cytometre en flux submersible et automatise (Cytosub, www.cytobuoy.com). La variabilite a court terme de l’assemblage phytoplanctonique a ete etudiee dans la baie de Marseille (Mediterranee nord occidentale) ou l’instrument, immerge a 2 m les etes 2005 et 2006, etait declenche toutes les 30 min. Les 7 groupes de cellules resolus dans la classe de taille 1-50 μm se comportaient comme des entites independantes et pourraient donc etre assimiles a des groupes fonctionnels de reponse. L’heterogeneite spatiale de la distribution du phytoplancton de surface a ete etudiee le long de la radiale Acores-Bretagne en avril 2007. Le Cytosub, place a bord d’une goelette de 33 m (Fetia Ura, www.seanergies.com), analysait l’eau de mer pompee sous le bateau chaque 15 min (resolution spatiale : 2,8 km). Des relations furent etablies entre la distribution des 6 groupes de cellules identifies et les differentes masses d’eau echantillonnees. La cytometrie en flux in situ et automatisee est un outil puissant pour etudier a haute frequence les assemblages phytoplanctoniques. Les developpements en cours visent a etendre les capacites de cette approche a l’ensemble des microorganismes marins et a automatiser le traitement des enregistrements.

Nouvelle méthode de monitoring in situ du phytoplancton : analyse automatisée à haute fréquence et à l'échelle individuelle des cellules