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La presente etude a evalue l’influence du type d’habitats sur la diversite et la structure des communautes des chiropteres dans les forets de Niaouli et de Lokoli situees au Sud du Benin. L’inventaire floristique est realise avec la methode de Braun-Blanquet et celui des chiropteres est fait au filet japonais. Ces deux formations forestieres ont montre une dissemblance sur le plan floristique avec une dissimilarite de 0,89 et au niveau des communautes de chiropteres qui y sont infeodees avec une dissimilarite de 0,61. Une DCA a aussi montre que les deux formations forestieres constituent deux ecosystemes differents de meme que les communautes des chiropteres associees. La majorite des especes de chiropteres recensees dans ces deux forets sont des especes dependantes des forets denses humides. Mimetellus moloneyi (Thomas 1891), Hipposideros fuliginosus (Temminck 1853) et Hipposideros tephrus (Cabrera 1906) rapportees sont nouvelles pour le Benin. Les especes communes aux deux ecosystemes sont caracteristiques des milieux degrades. La presence des trois nouvelles especes de chiroptere dans ces forets de Niaouli et de Lokoli montre qu’elles constituent deux ilots de forets denses humides dans cette region du pays et doivent etre conserves pour les generations actuelles et futures.

Communautés végétales et diversité des chiroptères dans les forêts de Niaouli et de Lokoli au Sud du Bénin