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L’identificazione rapida e specifica di batteri patogeni, nel trattamento di pazienti critici, rappresenta spesso l’evento cruciale nella diagnosi e nell’esito di infezioni gravi, principalmente nei reparti a rischio. Le metodiche microbiologiche tradizionali stanno gradatamente lasciando il passo all’avvento delle tecniche molecolari, grazie alla loro maggiore sensibilità e specificità e alla rapida capacità di predizione. Gli strumenti della biologia molecolare sfidano i test diagnostici più avanzati: sono a disposizione parecchi tests commerciali e non, basati sulle tecniche della PCR (amplificazione genica di specifici geni target e loci universali come il gene della 16S rRNA), dell’ibridazione genica (polimorfismi di regioni geniche altamente conservate come i geni housekeeping) e dell’ibridazione normale ed in situ (FISH) che consentono lo screening di un’ampia varietà di fattori genetici direttamente dal materiale patologico, aumentando non solo la sensibilità, ma riducendo drasticamente il tempo necessario per l’identificazione dei patogeni e i loro quadri di resistenza. Inoltre, tecnologie avanzate come la PCR-Real Time, il sequenziamento genico e i microarrays stanno creando nuove opportunità di sviluppo nel campo della microbiologia molecolare. Comparate con le normali tecniche fenotipiche tradizionali, le nuove tecnologie molecolari, basate sull’analisi del DNA, hanno i seguenti vantaggi: i) individuazione diretta e rapida identificazione di microrganismi che crescono lentamente o di germi particolarmente esigenti, difficili da coltivare in vitro; ii) possibilità di intraprendere studi epidemiologici, attraverso tecniche di: i) typing molecolare, mediante l’analisi dei polimorfismi dell’intero genoma o di specifiche regioni geniche (PFGE, RAPD, AFLP); ii) caratterizzazione mediante metodologie basata sulla sequenza degli acidi nucleici (MLST); iii) identificazione di markers genici di resistenza per specifiche classi di antibiotici. L’interpretazione del risultato di tests diagnostici molecolari, così come per i tests immunologici, deve essere criticamente valutato in relazione alla situazione clinica del paziente.

TECNICHE MOLECOLARI PER L’IDENTIFICAZIONE RAPIDA DI INFEZIONI DA MICRORGANISMI MULTI-RESISTENTI IN PAZIENTI CRITICI