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Cet article presente une methode de classification empietante permettant de mettre en evidence des zones denses en aretes dans un graphe. On cherche plus precisement a extraire du graphe des sous-graphes dont la densite en aretes soit elevee par rapport a la densite du graphe entier, ces sous-graphes pouvant avoir des sommets en commun. Cette methode est appliquee a un probleme issu de la biologique : l’annotation des proteines. Les graphes consideres traduisent alors des interactions observees entre les proteines. Partant du principe biologique que des proteines impliquees dans une meme fonction cellulaire interagissent, les sous-graphes obtenus par l’application de la methode de classification empietante aux reseaux d’interactions donnent des indications sur les fonctions des proteines constituant ces sous-graphes, ce qui permet de fournir une aide informatique a la prediction de fonctions inconnues de certaines proteines. Le caractere empitetant autorise par la methode presentee ici permet en particulier de prendre en compte le fait que les proteines peuvent etre impliquees chacune dans plusieurs fonctions cellulaires.

Recherche de classes empiétantes dans un graphe : application aux réseaux d’interactions entre protéines