English (United Kingdom)

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/featured_content/oa?rat=en

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/highlighted_journal/

Global: Zendy Plus annual

Presents the access of premium content as premium feature

Premium Content

Presents the keyphrase highlighting as premium feature

Keyphrase Highlighting

Presents the summarisation as premium feature

Summarisation

Insights

Presents the pdf analysis as premium feature

PDF Analysis

Presents the zaia usage as premium feature

ZAIA

Global: Zendy Tools annual

Global: Zendy Free Plan

Global: Zendy Tools monthly

Global: Zendy Plus monthly

DNA extraction from plant tissues is often problematic. For example, unsuccessful removal of secondary metabolites, such as phenolic compounds, during the extraction of the DNA of aromatic and medicinal plants results in errors in the results of molecular experiments. Achillea wilhelmsii is a medicinal plant which belongs to Asteraceae family and is native to Iran, there is little information about its genomic data. Therefore, the optimization of DNA extraction methods to obtain yield with higher quality and quantity is necessary. In this study, two traditional DNA extraction methods (using fresh and herbarium leaf samples) and a commercial DNA kit (MAGNANTM) in Yarrow were compared. Results showed that DNA extracted from fresh leaves of yarrow by the application of Khanuja et al. (1999) method was better than other methods mentioned in this research, because of increased amount of extracted DNA and reduced amount of harmful compounds such as RNA, polysaccharides, protein and secondary metabolites. The evaluation of the quality of extracted DNA from herbarium specimens showed that the quality of this extract was low on agarose gel because of the formation of smear and broken molecules, in spite of the high yielding DNA (10-50 fold ratio to the other methods). This can be considered to be a limitation of the extract in molecular experiments. The procedure of MAGNANTM DNA kit proved to be appropriate for reducing the time and cost of extraction as well as its low contamination of protein and RNA. However, this process still needs some modifications for yarrow to increase the amount of extracted DNA. Keyword. Achillea wilhelmsii, genomic DNA extraction, herbarium samples, magnetic nanoparticle, polyphenols D ow nl oa de d fr om n br .k hu .a c. ir at 1 :3 6 IR S T o n W ed ne sd ay J an ua ry 3 rd 2 01 8 [ D O I: 10 .2 92 52 /n br .5 .4 .4 58 ] ناراکمه و اروبص . شور هسیاقم جارختسا یاه DNA نارداموب زا Saboora et al. Comparison the DNA extraction methods from Achillea 459 / 459 همدقم زا یدایز دادعت تیلوباتم زا ینغ ناهایگ هیوناث یاه دنتسه و هزورما وراد دیلوت رد و دنیارف یاه ینامرد هب روط رتسگ دافتسا هد ه یم .دنوش نارداموب یتشد هاتوک ( Achillea wilhelmsiiK.Koch هب قلعتم ییوراد یهایگ ) ۀریت ناینساک ( Asteraceae ) هنوگ نیا .تسا یراصحنا هب و هدوب ناریا شخب رد هدرتسگ روط هب ناریا فلتخم یاه یبرغ و یزکرم قطانم رد هژیو دراد شنکارپ ( Asgary et al., 2000 .) میش تابیکرت رد دوجوم ییای شخب یاه دننام هایگ ییاوه نانگیل ،اهدیئونپرت ،اهدیئونولاف تاقتشم ،اه رد اهدیماکلآ و برچ یاهدیسا ،یدیساونیمآ لگ گرب و اه اه تخم ینامرد صاوخ یاراد یتنآ ،یبورکیمدض تیصاخ دننام فل دض ،ناطرسدض ،ینادیسکا شراوگ هاگتسد هدننک تظافح ،یباهتلا هریغ و دنتسه ( Lakshmi et al., 2011 ) . دیلوت یراجت تیلوباتم یاه هیوناث تابیکرت و ییوراد ناهایگ مهم ، هراصع قیرط زا یریگ ناهایگ یشحو هک یواح روخرد رادقم زا یهجوت نیا تابیکرت رثؤم ه دنتسه یم تروص دریگ ای زتنس اهنآ ییایمیش تاجناخراک رد ماجنا یم دوش . شور یاه دننام یژولونکتویب ک تش تفاب و لولس ،یهایگ تسد یراک یاه ،یکیتنژ تشک هشیر یاه نیئوم و یسدنهم تیلوباتم زین یم دروم اتسار نیا رد دناوت هجوت رارق .دریگ نیاربانب ،روشک یموب ییوراد ناهایگ مونژ تخانش جارختسا DNA ، نژ ییاسانش و مهم یمسیلوباتم یاهریسم رد یدیلک یاه یسررب مسیناکم یمیظنت ژ ن اه یتسیز تاعلاطم رد و یلوکلوم ثحابم هب روظنم شیازفا دیلوت تیلوباتم یاه هیوناث هژیو تیمها زا یا دنتسه رادروخرب ( Zhoua & Wu, 2006 ) . هنیهب یزاس دیسا جارختسا لحرم نیلوا کیئلکون یاه ماجنا رد ه تاعلاطم نیا تسا ( Alaey et al., 2007 .) لاح هب ات شور یاه رب یفلتخم جارختسا یا DNA تسا هدش هئارا ناهایگ زا . رد شور نیا باختنا اه ، ادتبا بسانم تفیک و تیمک DNA جارختسا و یگداس ،تعرس سپس و هدش شهاک هنیزه دنیارف جارختسا مهم تسا ( Rahim Malek, 2011; Lickfeldt et al., 2002 .) مدع تیفیک DNA جارختسا هدش هب تسا نکمم لوکلوم هیزجت لیلد DNA تلع هب یکیناکم تامدص درکلمع ، میزنآ زائلکون یاه ی و لیلد هب ای رثا هتساوخان تابیکرت رد دنیارف جارختسا DNA .دشاب یصلاخان نیا هدافتسا دروم ییایمیش تابیکرت لماش اه رد لولحم جارختسا یارب هدش هدرب راکب DNA تاردیهوبرک ای نیئتورپ ،اه اه تیلوباتم و گ هیوناث یاه یهای دنتسه ( Sahare & Srinivasu, 2012 ) . زا یکی لاکشم ت هک ی بلغا یصلاخان دوجو لیلد هب خر اه یم دهد آ یلپ لیبق زا یتابیکرت هک تسا ن س تابیکرت و اهدیراکا دیسا اب یلنف اه ی کیئلکون مه هتفات لیکشت یم دنهد . یلپ لنف اه یم دنناوت نویسادیسکا ثعاب DNA دنوش ( Khanuja et al., 1999; Varadarajan & Prakash, 1991 .) نینچ دوجو یگدولآ لولحم رد ییاه DNA یم دناوت عنام یدعب لحارم رد میزنآ تیلاعف یاه Taq شنکاو رد زارمیلپ هریجنز زارمیلپ یا ( PCR ) میزنآ و ( دنوش رگشرب یاه Bushra et al., 1999 .) ب نیاربان یسررب شور جارختسا یاه ندرب لااب تهج مک تیفیک و تی DNA هدش جارختسا .تسا یرورض تاعلاطم رد Prittila ناراکمه و (2001) تهج یدیدج شور جارختسا DNA هئارا نارداموب دننام یناهایگ زا ش زا نآ رد هک د و لوناتاوتپاکرم یلپ نودیلوریپ لینیو ( PVP ) هب مه روط یارب نامز هدافتسا نویسادیسکا لکشم عفر یم ر نیا رد .دش ،اتسا Rahim Malek جارختسا شور راهچ DNA زا رطعم و ییوراد ناهایگ فلتخم لماش ( نارداموب هنوگ دنچ Achillea L. ) ار تحت رب ر یس داد رارق ( Rahim Malek, 2011 ) هک داد ناشن قیقحت نیا جیاتن . ناهایگ نایم رد تحت هنوگ یسررب نازیم نیرتشیب نارداموب یاه یلپ یصلاخان و یدیراکاس نویسادیسکا DNA دنتشاد ار زین اهنآ . شهاک نویسادیسکا نازیم DNA هزادنا قبط ار هدش یریگ شور جارختسا Pirttila ( ناراکمه و 2001 ) دیئات درک .دن Khanuja و ناراکمه یارب ار یلمعلاروتسد عیرس جارختسا DNA ناهایگ زا و ییوراد رطعم فلتخم اب یاوتحم تیلوباتم اسا و هیوناث یاه سن ناوارف رشتنم درک دن ( Khanuja et al., 1999 ) رد ،شور نیا . یخرب عبانم بلغا یارب بسانم یشور ناونع هب ،تارییغت یکدنا اب یفرعم ییوراد ناهایگ تسا هدش ( Sahare & Srinivasu, 2012; Viana et al., 2015; Zabeti et al., 2014 .) یفرط زا تیک زا هدافتسا هزورما سا یراجت یاه جارخت DNA ، رانک رد شور یاه یمیدق یهاگشیامزآ .تسا هتفای شرتسگ ، رد زا یدادعت شرازگ ش نایب اه د هک تسا ه اب هسیاقم رد جارختسا تیک زا هدافتسا شور ،یتسد یاه DNA صلاخ ار یرت مهارف یم دنک ( Del Serrone et al., 2007; Sameer et al., 2009 ) . یزاسادج لوکلوم یسیطانغم یاه زا هدافتسا اب یتسیز یسیطانغم تارذونان یروانف زا یکی یاه دیدج لاس رد هک تسا یاه یارب ریخا D ow nl oa de d fr om n br .k hu .a c. ir at 1 :3 6 IR S T o n W ed ne sd ay J an ua ry 3 rd 2 01 8 [ D O I: 10 .2 92 52 /n br .5 .4 .4 58 ] هتفای مولع رد نیون یاه دلج ،یتسیز 5 ۀرامش ، 4 : 465 458 Nova Biologica Reperta 5(4): 458-465 (2019) 460 / 460 لوکلوم عاونا جارختسا تسا هتفرگ رارق هدافتسا دروم یتسیز یاه . هک تسا هدش شرازگ و سامت حطس شیازفا لیلد هب تارذونان کیئلکون یاهدیسا جارختسا رد ییلااب ییاناوت ،بذج ناشن یم نهد .د یط هدافتسا زا تیک نیا یاه یراجت هکنیا رب هولاع هب یزاین زا هدافتسا هاگتسد هدیچیپ یاه ،تسین جارختسا نامز DNA زین هب لباق روط هظحلام شهاک یا یم دبای ( Rahnama et al., 2016 .) لماع نیمود رثؤم یسررب رد یهایگ تفاب باختنا یلوکلوم یاه بسانم تسا لاومعم . گرب اه ی و هزات بوخ عبانم ناونع هب ناوج جارختسا DNA هتفرگ رظن رد یم ش و دن . اما رد رضاح لاح هدافتسا هایگ زا نا و کشخ هدکایگ یا زین هب لباق روط تاعلاطم رد یهجوت یشیازرابت ( تسا هتفای شیازفا یلماکت و Cota-Sánchez et al., 2006 .) هنومن زا هدافتسا ییاناوت یاه هدکایگ یا ات یدایز دح یم دناوت هتفای یاه شهوژپ ی .دهد اقترا ار ییاناوت زا هدافتسا هنومن اه ی هدکایگ یا و ت غ ذ ی زا ه نیا هعومجم اه ناکما اقترا هتفای یاه شهوژپ ی ار هزورما .تسا هداد شیازفا هب ناسآ یسرتسد رطاخ هب هنومن نیا و اه جارختسا DNA زا ،اهنآ یلاوت ییاسانش ای هژیو یاه نژ صاخ یاه رد هیارآ یاه نآ جیاتن دربراک و لیهست فلتخم رد تاعلاطم هیارآ یتخانش و یلوکلوم ش ریگارف د تسا ه ( Drábková, 2014; Gaudeul & Rouhan, 2013 .) هدرس یاراد ناریا رد نارداموب 19 .تسا هنوگ رد هک اجنآ زا ناریا تاعلاطم نونکات یلوکلوم یمک یور نآ یگ کی ناونع هب ها یراصحنا هتفرگ تروص ورنیا زا ،تسا عمج هداد یروآ یاه یارب یکیتنژ یسررب یزتنسویب یاهریسم اب هطبار رد هتفرشیپ یاه تیلوباتم نآ مهم یاه هب یرورض یم رظن دسر . جارختسا DNA زا یرایسب دننامه یلوکلوم تاعلاطم یارب نارداموب هایگ زا بسانم تابیکرت و سناسا زا ینغ ناهایگ هدیچیپ ییایمیش رایسب لکشم .تسا نیا زا فده هعلاطم هنیهب جارختسا یزاس DNA هایگ بسانم تفاب زا نارداموب تسا و شیامزآ اه هطوبرم ی هنوگ یور Achillea wilhelmsii تسا هدش ماجنا روظنم نیا هب . هس شور جارختسا تحت رارق هسیاقم تفرگ شور ود : جارختسا DNA زا هزات گرب و ومن هدکایگ هن یا زا هدافتسا اب لمعلاروتسد یاه و یتنس موس شور جارختسا DNA ب زا کمک هب هزات گر تیک TM MAGNAN تکرش( ونانلیگ نژ )ناریا ،نارهت ، ات تیاهن رد اب هدمآ تسدب لوصحم تیمک و تیفیک هب هجوت شور نیرتهب ا جارختس DNA تشد هاتوک نارداموب زا یفرعم دوش . شور و داوم اه یزاس هدامآ یهایگ هنومن هب ب روظنم ه تسد گرب ندروآ جارختسا تهج هزات یاه DNA ، رذب نارداموب هایگ یاه یتشد هاتوک یعیبط هاگشیور زا رد یاتسور ( ناقداو زا عباوت شخب رساین ناتسرهش ناهفصا ناتسا ،ناشاک ، عافترا 1897 رتم زا حطس ایرد ، ضرع ییایفارغج 518 / 51 ، لوط ایفارغج یی 9 / 34 رد ) تشهبیدرا هام طسوت و نایبجر هبیط هناحیر ییاناد روپ عمج یروآ نورتس زا سپ و دندش لکلا اب یزاس 70 دصرد ، یراجت میدس تیرلکوپیه 20 دصرد رطقم بآ اب وشتسش و نومروه نودب و دماج تشک طیحم یور MS ( Murashige & Skoog, 1962 ) .دندش هداد تشک یرتپ ا رد اه ت تشک قا تدم هب 24 یامد رد تعاس 2 ± 23 دارگیتناس هجرد یکیرات رد و رارق تفرگ دن ، سپس هب یرون هرود 16 و ییانشور تعاس 8 تعاس .دندش لقتنم یکیرات هچهایگ هام ود یاه و تشادرب ه رزیرف رد 70 دارگیتناس هجرد .دندش یرادهگن هدافتسا نامز ات نینچمه یارب هنومن هدکایگ یا هنومن زا یاه کشخ گ نیمه هدش رد هک هنو هام تشهبیدرا 1389 عمج هنومن و یروآ دهاش رد نآ مویرابره نارهت هاگشناد هرامش هب TUH-43916 یم یرادهگن دوش ، هدافتسا دش . جارختسا DNA جارختسا یارب هدش هدافتسا شور هس DNA ریز حرش هب تسا : لوا شور لمعلاروتسد هدش حلاصا Khanuja ناراکمه و ( 1999 ) : رادقم 5 / 0 مرگ رد گرب هزات تفاب کمک اب ینیچ هتوب رد و هدیئاس عیام تزا 1 یلیم رتیل رفاب جارختسا CTAB ( 100 یلیم رلاوم Tris-Cl ( pH= 8 ) ، 25 لیم ی لاوم ر EDTA ، 5 / 1 رلاوم NaCl ، 5 / 2 دصرد CTAB ، 2 / 0 و لوناتاوتپاکرماتب دصرد 1 دصرد لینیویلپ )نودیلوریپ لح طولخم .دش لصاح رد هلول کی هب نوکلاف تدم 2 1 یامد رد تعاس 60 دارگیتناس هجرد مامح رد هبوکنا یبآ دش . س سپ 1 یلیم رتیل :مرفورلک لولحم لکلا لیمآوزیا ( یمجح تبسن هب 24:1 هب و هفاضا هنومن هب ) تدم 15 هقیقد هب روط یمارآ هب یقفا ور و ریز تعرس اب هنومن .دش rpm 8000 تدم هب 20 قیقد یامد رد ه 25 دارگیتناس هجرد ژویفیرتناس ( Spectrafuge 24D, labnet-USA ) دش ییور هیلا . و ادج 5 / 0 یلیم رتیل لولحم 5 رلاوم NaCl و تبسن هب لوناپورپوزیا لولحم 5 / 0 مجح بیترت هب نآ هب تدم هب لصاح لولحم و هفاضا 1 قاتا یامد رد تعاس D ow nl oa de d fr om n br .k hu .a c. ir at 1 :3 6 IR S T o n W ed n

Comparison study of three methods for genomic DNA extraction from fresh and herbarium leaf specimens of Achillea wilhelmsii C.Koch