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En este estudio, los analisis con marcadores RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) fueron usados para estimar la diversidad genetica yla relacion de 20 accesiones de Theobroma cacao L. de la variedad Nacional en la finca (La Buseta) ubicada en la Parroquia Tenguel provincia del Guayas. Las plantas fueron seleccionadas con criterios de productividad, resistencia, susceptibilidad a enfermedades causadas por hongos como Ceratocystis fimbriata, Moniliophtora roreri y Crinipelis perniciosa. Se utilizaron 14 primers, de los cuales nueve amplificaron, generando 67 bandas de las cuales 59 (88%) fueron polimorficas. Losresultados indican la formacion de dos grupos de accesiones A y B, en el grupo A se incluyen dos accesiones y, en el grupo B se encuentran 18 de los cuales incluyen 2 subgrupos B1 y B2. E el subgrupo B1 se incluye la accesion (L-22-H-40), y en el subgrupo B2 estan incluidas las accesiones que poseen caracteristicas de productividad. El nivel de diversidad genica mas alto se obtuvo con los primers OPC 04 (0,80), OPC 07 (0,82) y el nivel mas bajo fue OPC 01 (0,37). Las accesiones (L-22-H-40; 0,75; L-34-H-07; 0,86) y el (L-42-H-60; 0.72) presentaron los niveles de variabilidad genica mas altas, siendo los valores mas bajos los mostrados por las accesiones (L-26-H-64; 0,48) y (L-23-H63; 0,47). El valor de la diversidad total (Ht) obtenida para las 20 accesiones de T. cacao L. mediante RAPD fue de 0,636.

Análisis RAPD de la diversidad genética de Theobroma cacao L. de una población del Litoral Ecuatoriano