English (United Kingdom)

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/featured_content/oa?rat=en

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/highlighted_journal/

Global: Zendy Plus annual

Presents the access of premium content as premium feature

Premium Content

Presents the keyphrase highlighting as premium feature

Keyphrase Highlighting

Presents the summarisation as premium feature

Summarisation

Insights

Presents the pdf analysis as premium feature

PDF Analysis

Presents the zaia usage as premium feature

ZAIA

Global: Zendy Tools annual

Global: Zendy Free Plan

Global: Zendy Tools monthly

Global: Zendy Plus monthly

Институт вычислительных технологий СО РАН Новосибирск, Россия Аннотация Работа посвящена описанию структуры информационно-аналитической системы «Ixodes», ориентированной на работу c представительной коллекцией иксодовых клещей из разных биотопов, а именно для территорий Алтая, Сибири и Дальнего востока. Показаны варианты применения системы для анализа генетического разнообразия клещей и переносимых ими патогенов при помощи методов статистической обработки в виде круговых и столбчатых диаграмм (гистограмм). Описаны реализованные алгоритмы, позволяющие проводить анализ генетической последовательности исследуемого патогена на основе L-граммного подхода и методами разбиения филогенетического дерева на группы близких последовательностей. При этом для первичной обработки набора геномов используются методы множественного выравнивания последовательностей и метод присоединения соседей, позволяющий выполнить построение филогенетического дерева. Представленные алгоритмы и методы использовались для решения задачи генотипирования вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). Представлены результаты апробации для методов разбиения филогенетического дерева и их сравнительный анализ. Описана архитектура информационно-аналитической системы для анализа набора геномов. Система предназначена для анализа множества геномов и их классификации, а именно для анализа генотипов внутри одного вида живых организмов, поскольку методы направлены для выделения различий геномов, имеющих схожую структуру. Ключевые слова информационные системы, интеграция данных, классификация, кластеризация, L-граммный анализ, филогенетическое дерево, клещи, секвенирование, энцефалит, штамм Благодарности Исследования выполнены при частичной поддержке гранта РФФИ No 18-07-01457, Интеграционного проекта СО РАН No АААА-А18-118022190008-8 (No 0316-2018-0002) и темы госзадания No АААА-А17-117120670141-7 (No 0316-2018-0009). Для цитирования Черненко В. В., Молородов Ю. И. Информационно-аналитическая система с алгоритмами геномного анализа патогенов вирусных инфекций // Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии. 2019. Т. 17, No 1. С. 90– 100. DOI 10.25205/1818-7900-2019-17-1-90-100

vestnik novosibirskogo gosudarstvennogo universiteta. seriâ: informacionnye tehnologii/vestnik novosibirskogo gosudarstvennogo universiteta. seriâ: informacionnye tehnologii v obrazovanii

The Information-Analytical System with Using Algorithms Genomic Analysis of Pathogens of Viral Infections