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O armazenamento de dados genomicos e um grande desafio hoje, pois com o avanco da tecnologia molecular a quantidade de dados genomicos gerados esta aumentando, de forma que o sequenciamento de um unico organismo pode gerar arquivos com gigabytes de informacoes. De forma geral, os processos de manipulacao de dados genomicos fazem uso de simples arquivos como o principal meio para armazenamento de tais dados. Contudo, os bancos de dados modernos se apresentam como alternativa para a gerencia desses dados por oferecer melhor organizacao, tolerância a falhas, melhor uso do espaco disponivel para armaze- namento e desempenho. Alem disso, os bancos de dados permitem agregar aos dados brutos do sequenciamento meta-informacoes acerca das sequencias de DNA armazenadas. Diante deste cenario, este trabalho apresenta e avalia o desempenho de diferentes estrategias de armazenamento em tres bancos de dados pertencentes a dois paradigmas diferentes, o MySQL (representante dos bancos de dados Relacionais), o Cassandra e o MongoDB (representantes dos bancos de dados Nao Relacionais). Os resultados demonstraram que os bancos de dados relacionais apresentam limitacoes quando estao inseridos em um ambiente com grandes massas de dados.

Análise de desempenho de Banco de Dados Relacionais e Não Relacionais em dados genômicos