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La arracacha (Arracacia xanthorrhiza Bancroft es una Apiaceae con raices tuberosas preservantes ricas en un fio y nutritivo almidon. Los microsatelites o SSR’s, secuencias simples de ADN con motivos de 1 a 6 nucleotidos repetidos en tandem, poseen caracteristicas utiles para estudiar la diversidad genetica de una poblacion. En el municipio de Boyaca, Boyaca, los agricultores identificaron mediante diferencias fenotipicas siete cultivares de arracacha. Esta investigacion busca identificar los loci polimorficos y reproducibles para siete cultivares natios de arracacha entre un conjunto de 14 loci SSR’s disenados a parti de un cultiar ecuatoriano. Se amplifico y evaluo el ADN de los cultivares de arracacha con diferentes concentraciones de MgCl y temperaturas de anillamiento para cada locus microsatelite. Los productos amplificados se separaron en geles de poliacrilamida al 6, 10 y 12%. La estandarizacion para cada locus logro reducir las bandas inespecificas en un 80% y evidenciaron una resolucion optica de las bandas en poliacrilamida al 12%. Se detecto que 5 loci no son aptos para el analisis de la variabilidad de arracacha debido a que loci son monomorficos, mientras que 1 locus polimorfico presenta exceso de bandas inespecificas. Se identificaron fragmentos polimorficos reproducibles en 9 loci microsatelites y se confirmo su uso para el analisis de la variabilidad genetica de los cultivares nativos de arracacha: paliverde, palirrusia, palinegra, yema de huevo, blanca de tarro, yucatana y amarilla de tarro.

Selección de marcadores microsatélites (SSR’s) para el análisis de variabilidad genética en siete cultivares de arracacha (Arracacia xanthorrhiza)