Plasmid-mediated fluoroquinolone resistance in clinical isolates of Escherichia coli in Konya, Turkey
Author(s) -
Dhay Ali Azeez,
Duygu Fındık,
Hatice Türk Dağı,
Uğur Arslan
Publication year - 2018
Publication title -
çukurova medical journal (online)/çukurova medical journal
Language(s) - Turkish
Resource type - Journals
eISSN - 2602-3040
pISSN - 2602-3032
DOI - 10.17826/cumj.341637
Subject(s) - plasmid , gene , efflux , amplicon , biology , escherichia coli , quinolone , microbiology and biotechnology , polymerase chain reaction , genetics , antibiotics
Amac: Kinolonlara karsi direnc gelisimi, genellikle kromozomlarla kodlanan topoizomeraz ve efflux pump genlerindeki mutasyonlara, porin kaybina ve plasmid aracili genlerin transferine bagli olarak gelismektedir. Bu calismanin amaci, Selcuk Universitesi, Konya/Turkiye’de Escherichia coli klinik izolatlarinda plazmid aracili kinolon direnc genlerinin (qnrA, qnrB, qnrC, qnrS, qepA, and aac(6’)-1b-cr) varligini arastirmaktir. Gerec ve Yontem: Bu calismada, qnrA, qnB, qnrC, qnrS, qepA, and aac (6’)-1b-cr genleri kinolon direncli 115 E. coli susunda polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile arastirildi. Tum aac (6’)-1b-cr varyantini tanimlamak icin aac (6’)-1b pozitif amplikonlar BseGI restriksiyon enzimiyle kesilerek arastirildi. Bulgular: 115 kinolon direncli E.coli susundan ucunde (% 2.6) qnrB, dokuzunda (% 7.8) qnrS ve ellisinde (% 43.5) aac (6’)-1b-cr genleri pozitif bulundu. Suslarin hicbirinde qnrA, qnrC ve qepA genleri tespit edilmedi. Sonuc: Turkiye Konya’da E. coli klinik suslarinda kinolon direncinden, aac (6 ‘)-1b-cr geninin sorumlu oldugu belirlendi. qnrB ve qnrS gen sikligi dusuk olarak tespit edildi ve qnrA, qnrC ve qepA genleri tespit edilmedi. Kinolon direnc genlerinin surveyansi onemlidir, ozellikle plazmid aracili olanlar tum dunyaya hizla yayilmaktadir.
Accelerating Research
Robert Robinson Avenue,
Oxford Science Park, Oxford
OX4 4GP, United Kingdom
Address
John Eccles HouseRobert Robinson Avenue,
Oxford Science Park, Oxford
OX4 4GP, United Kingdom