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The biodiversity of marine heterotrophic protists is poorly known in the South Atlantic coastal zone (~32 °S) especially regarding the nanoflagellates. The presence of loricate choanoflagellates was reported for the first time in the Patos Lagoon estuary and the adjacent coastal zone. Seventeen species of eleven genera of loricate choanoflagellates were observed between October 1998 and May 2000 in fixed water samples (lugol's solution + glutaraldehyde) in a JEM 100-SX transmission electron microscope. Most species were recorded in euhaline and mixopolyhaline waters during the spring and summer, none in autumn and a few (four) in winter. The absence of choanoflagellates at the more sheltered inshore stations is due freshwater influence, and at the beach station,probably due the strong wave action. The probably cosmopolitan species Pleurasiga minima, Cosmoeca norvegica, C. ventricosa and Parvicorbicula circularis were present in spring or summer in the estuary channel and coastal area while Stephanoeca diplocostata which apparently prefers lower temperature, was recorded in winter. Calotheca alata and Campyloacantha spinifera are mainly temperate species and were present in spring. The new species Diplotheca tricyclica was recorded at the estuary channel in the summer 1999, in high salinity water.A biodiversidade de protistas heterotróficos é pouco conhecida na zona costeira do Atlântico Sul (~32 °S), especialmente dos nanoflagelados. No presente estudo, foi registrada pela primeira vez a presença de coanoflagelados loricados no estuário da Lagoa dos Patos e na zona costeira adjacente. Dezessete espécies de onze gêneros de coanoflagelados loricados foram observadas em amostras de água fixadas (solução de lugol + glutaraldeido) coletadas entre outubro de 1998 e maio de 2000, e analisadas em microscópio de transmissão JEM 100-SX. A maior parte das espécies foi registrada em águas euhalinas e mixopolihalinas durante a primavera e o verão, nenhuma no outono e poucas (quatro) no inverno. A ausência de coanoflagelados nas estações mais protegidas deve-se a influência da água doce, e na estação da praia deve-se, provavelmente, a forte ação das ondas. As espécies, provavelmente cosmopolitas, Pleurasiga minima, Cosmoeca norvegica, C. ventricosa and Parvicorbicula circularis ocorreram na primavera ou no verão no canal principal do estuário e na área costeira, enquanto Stephanoeca diplocostata, que aparentemente prefere baixas temperaturas, foi registrada no inverno. Calotheca alata e Campyloacantha spinifera são principalmente de ambientes temperados e estiveram presentes na primavera. Uma espécie nova, Diplotheca tricyclica, foi registrada na área do canal principal do estuário, no verão de 1999, em águas de alta salinidade

Loricate Choanoflagellates from the South Atlantic coastal zone (~32 °S) including the description of Diplotheca tricyclica sp. nov.