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Os crocodilianos Amazonicos sao incluidos em tres generos, Caiman, Melanosuchus e Paleosuchus. Dentro destes, duas especies merecem atencao especial porque foram muito exploradas em decadas passadas e hoje passam por uma recuperacao populacional, o jacare-tinga (Caiman crocodilus) e o jacare-acu (Melanosuchus niger), que sao os crocodilianos mais abundantes da Amazonia brasileira. Esta pesquisa foi realizada com o objetivo de quantificar o grau de variabilidade genetica e estrutura populacional dos crocodilianos M. niger e C. crocodilus, atraves de um marcador de linhagem materna (gene mitocondrial citocromo b), e desta forma, contribuir com informacoes que possam ser utilizadas em futuros planejamentos para a conservacao e o manejo destas especies. Com base nas analises de aproximadamente 1.080 pares de bases obtidas para um total de 125 individuos de C. crocodilus e 132 de M. niger provenientes de 9 e 11 localidades respectivamente, em diferentes regioes da Amazonia Brasileira, Peru, Equador e Guiana Francesa, foi possivel identificar padroes geneticos biogeograficos. Os resultados demonstram que algumas populacoes de ambas as especies estao em expansao populacional mostrando um numero relativamente grande de haplotipos unicos. Ambas as especies apresentaram elevada diversidade genica e baixa diversidade nucleotidica. As analises de clados agrupados indicaram expansao, colonizacao a longa distância e fragmentacao no passado, como possiveis eventos historico-demograficos em populacoes de C. crocodilus. Em M. niger, os dados nao foram conclusivos para identificar possiveis eventos historicos. Entretanto, possibilitaram identificar a existencia de correlacao entre divergencia genetica e distância geografica. Esta correlacao tambem foi identificada pelo teste de Mantel, indicando isolamento por distância em M. niger e pelos valores significativos de pairwise Fst que confirmaram a ocorrencia de fragmentacao. Esta fragmentacao foi identificada entre as populacoes oriundas de rios que desagua diretamente nas drenagens do oceano Atlântico em relacao as populacoes da bacia Amazonica, entretanto, dentro da bacia Amazonica algumas populacoes tambem apresentaram estrutura genetica populacional, como por exemplo, a populacao de M. niger do rio Napo. As populacoes da Guiana Francesa e do Estado do Amapa representam potenciais unidades evolutivas diferenciadas das populacoes da bacia Amazonica.

Diversidade genética e estrutura populacional dos crocodilianos jacaré-açú (Melanosuchus niger) e jacaré-tinga (Caiman crocodilus) da Amazônia