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To assess genetic structure and phenotypic diversity of Eupemphix nattereri Steindachner, 1863, morphometric and molecular analyses were carried out for nine populations from the State of Goiás. A total of 11 morphometric traits were evaluated and genetic information was estimated using RAPD markers. Genetic and phenotypic distances were determined as a function of geographical origin. Correlation among genetic, morphometric, micro, and macroenviromental were analyzed by the Mantel test. Genetic data indicated high levels of genetic diversity (&#934;st= 0.3) among the nine populations. Mantel tests did not reveal a significant positive correlation between genetic and geographical distances, indicating that locally geographical populations were not genetically similar, even in distances smaller than 50 km. Discriminant analysis on 11 morphometric measurements showed a high divergence among the nine populations. However, a marginally significant correlation (P=0.08) between genetic and morphometric distances was found. The observed correlation was not causal in terms of the relationship between phenotype and genotype, but indicated common spatial structures. Thus, our results suggest that isolation-by-distance processes may explain population divergence in Eupemphix nattereri. Visando conhecer a estrutura genética e a diversidade fenotípica da espécie Eupemphix nattereri Steindachner, 1863, análises morfométricas e moleculares foram realizadas em nove populações do Estado de Goiás. Onze caracteres morfométricos foram avaliados e a diversidade genética foi estimada com o uso de marcadores RAPD. As matrizes de distâncias genéticas e fenotípicas foram correlacionadas com as distâncias geográficas e dados macro e microambientais, utilizando o teste de Mantel. Em relação aos caracteres genéticos, foram encontrados altos níveis de diversidade (&#934;st= 0,3) entre as nove populações. Não houve, entretanto, uma correlação positiva significativa entre as distâncias genéticas e geográficas, indicando que populações geograficamente próximas não seriam geneticamente similares, mesmo estando situadas entre distâncias menores do que 50 km. Uma análise discriminante dos onze caracteres morfométricos evidenciou também uma elevada divergência entre as nove populações. Entretanto, foi encontrada uma correlação quase significativa (P=0,008) entre as distâncias genéticas e morfométricas. A correlação observada não foi casual entre fenótipo e genótipo, mas indicou estruturas espaciais comuns. Desta forma, nossos resultados sugerem que processos de isolamento por distância poderiam explicar a divergência populacional na espécie Eupemphix nattereri

Morphometric and genetic differentiation among populations of Eupemphix nattereri (Amphibia, Anura, Leiuperidae) from central Brazil