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Die Rekonstruktion von Stoffwechselwegen fußt auf genomischen und biochemischen Daten. Mit diesen Daten soll eine höhere Interaktionsebene zwischen Enzymen in einem spezifischen Genom dargestellt werden. Dabei geht es vor allem um Stoffwechselwege in einer Spezies oder einem Individuum (Patient). Es wird der Fluss der Metabolite in einem Netzwerk aus unterschiedlichen Stoffwechselwegen mit verschiedenen Werkzeugen wie zum Beispiel der Elementarmodenanalyse untersucht. So werden Schlüsselenzyme und potenzielle medizinische Ziele erkannt.

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Stoffwechselanalyse: Der Weg vom Genom zum metabolischen Netzwerk (Pathway Analysis: On the Route from Genomics to Metabolic Networks): Pathway Analysis: On the Route from Genomics to Metabolic Networks