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Tumoren des Gesauges sind die haufigste Krebsart bei Hundinnen, die eine grose histopathologische Variabilitat aufweisen. Jedoch ist uber die genaue genomische Zusammensetzung dieser Tumore nur wenig bekannt. ImRahmen einer Studie haben wir Mammakarzinome von funf Hundinnen mit modernen Hochdurchsatzsequenzierungstechnologien auf strukturelle und Kopienzahlveranderungen im Vergleich zum somatischen Genom analysiert und diese mit einer „droplet“ digitalen PCR (ddPCR) validiert. Neben chromosomalen Aneuploidien konnten auserdem kleinere Deletionen und interchromosomale Fusionen in den Tumoren nachgewiesen werden. Haufig waren von den Aberrationen bekannte Oncogene, wie cMYC und KIT, betroffen. In vier der Tumoren konnte eine Deletion des proximalen Endes von Chromosom 27 nachgewiesen werden, in der das Tumorsuppressorgen Prefoldin 5 (PFDN5) gelegen ist. Mittels ddPCR konnte diese Deletion in 50%derMammakarzinome (N = 20) detektiert werden. Zum Nachweis der Deletion in zellfreier plasmatischer DNA wurde eine Bruchpunkt spezifische PCR entwickelt. Bei einerHundin konnten spezifische Signale noch ein Jahr nach der Operation festgestellt werden, welche auf eine Lungenmetastase zuruckzufuhrenwaren. Durch Sequenzierung der zellfreien plasmatischen DNA konnte gezeigtwerden, dass samtliche chromosomalenAberrationen auch im Blut der Hundinnen nachweisbar waren. Neben spezifischen caninen zeigten die identifizierten Veranderungen Ahnlichkeiten mit humanen Tumoren. Unsere Ergebnisse zeigen, dass es moderne Hochdurchsatzsequenzierungstechnologien erlauben individuelle Tumormarker zu identifizieren, die eine gezielte Uberwachung der Tumorentwicklung und Metastasierung ermoglichen.

Genomische Aberrationen in caninen Mammakarzinomen und deren Nachweis in zellfreier plasmatischer DNA