English (United Kingdom)

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/featured_content/oa?rat=en

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/highlighted_journal/

Global: Zendy Plus annual

Presents the access of premium content as premium feature

Premium Content

Presents the keyphrase highlighting as premium feature

Keyphrase Highlighting

Presents the summarisation as premium feature

Summarisation

Insights

Presents the pdf analysis as premium feature

PDF Analysis

Presents the zaia usage as premium feature

ZAIA

Global: Zendy Plus monthly

Global: Zendy Tools annual

Global: Zendy Tools monthly

Global: Zendy Free Plan

Jelenleg vilagszerte es hazankban is a szarazsagstressz az egyik legjelentősebb termes korlatozo tenyező a gabonafelek, igy az arpa eseteben is. Kovetkezeskeppen a legfőbb nemesitesi celok koze tartozik uj, fokozottabb szarazsagtoleranciaval rendelkező fajtak előallitasa. A nemesites sikeressege nagymertekben fugg attol, hogy sikerul-e megertenunk e komplex es kvantitativ jellegű tulajdonsag kialakitasaban reszt vevő genetikai faktorokat. A komplex tulajdonsagok, mint peldaul a szarazsaghoz tortenő alkalmazkodas fejleszteset elősegitheti a genomikai es fenomikai megkozelitesek kombinacioja. A meglevő termeszetes genetikai variabilitas meghatarozasa pedig ertekes informacioval szolgalhat a szarazsagtűresben resztvevő genek funkciojat illetően. A genotipus-fenotipus asszociaciok egyuttes vizsgalata lehetőve teheti a vizsgalt genjeloltek szarazsagtoleranciaban betoltott funkciojanak megerősiteset. Az arpa szarazsagtűresben potencialisan szerepet jatszo genjeloltek genomikai adatait a polimorfizmusok hatekony feltarasara alkalmas EcoTILLING technologia hasznalata utjan nyertuk. A fenomikai adatsorokat uveghazi korulmenyek kozott, Komplex Stressz Diagnosztikai Rendszer alkalmazasaval allitottuk elő. Az EcoTILLING modszer egy nagy kapacitasu, viszonylag alacsony koltseggel kivitelezhető eljaras, mely lehetőve teszi a termeszetes populaciokban megtalalhato polimorfizmusok hatekony detektalasat. A modszer a TILLING (Targeting Induced Local Lesions IN Genomes) technologia egyik valtozata, amely bizonyos PCR lepeseken alapszik, ugymint heteroduplex kezes, valamint a kialakult mismatch poziciok nukleaz enzimekkel tortenő emesztese. A technologia alkalmazasa utjan egyarant lehetőve valik a polimorfizmusok feltarasa, illetve a haplotipusok elkulonitese az azonositott egyedi haplotipusok szekvenalasa utjan. Kutatasaink celjai kozott szerepelt az arpa szarazsagtűresenek hattereben allo genetikai faktorok vizsgalata a fenomikai es genomikai megkozelitesek egyesitesenek utjan. Az EcoTILLING reakcio magaban foglalta a vizsgalt genszakasz fluoreszcens nukleotidok jelenleteben vegzett PCR-amplifikaciojat. A kapott amplikonokat a heteroduplex kepzes utan az egyszalu DNS-re specifikus aktivitassal rendelkező Cel1-es endonukleazzal emesztettuk a „mismatch” poziciokban, majd ABI 377-es szekvenalo keszuleken kulonitettuk el a fragmentumokat molekulameretuk szerint. Vegul az azonositott haplotipusokat forward es reverz iranybol is megszekvenaltuk. Vizsgalatainkhoz a vilag szamos pontjarol gyűjtott 96 genotipust /termesztett fajtakat, okotipusokat es vad valtozatokat/ is tartalmazo, szarazsagtűres szempontjabol variabilis arpa kollekciot allitottunk ossze. A genjeloltek kivalasztasa soran a szarazsagtűressel foglalkozo szakirodalmi adatokra (gen expresszios, illetve QTL terkepezesi vizsgalatok, transzgenikus kutatasok) tamaszkodtunk. Elsődleges celunk volt az arpa szarazsag tűreseben potencialisan szerepet jatszo genjeloltek termeszetes genetikai variabilitasanak feltarasa az EcoTILLING technologia, mint a polimorfizmusok azonositasara alkalmas eszkoz alkalmazasa utjan. Tovabbi celjaink kozott szerepelt konnyen detektalhato genetikai markerek (potencialisan „genen beluli markerek”) kifejlesztese az atfedő haplotipus szekvenciak birtokaban, amelyek lehetőve teszik a főbb, elsősorban aminosav szinten kulonbseget mutato haplotipusok elkuloniteset. Az alkalmazott technologia segitsegevel mintegy 1,5 millio bazisparnyi szekvencia vizsgalata nyoman 94 egyedi allelvarianst kulonitettunk el a 9 genre tervezett 18 amplikon elemzese utjan. Egy bazisparnyi elterest (SNP) 185, inszercio/delecio-t (InDel) pedig 46 esetben azonositottunk, a polimorfizmusok atlagos gyakorisaga 1 SNP/92 bp illetve 1 InDel/372 bp volt. Az amplikonok vizsgalata soran az azonositott haplotipusok szama 2 es 9 koze esett. Osszesen 4 gen – Hordeum vulgare L. AR-h gene for aldose reductase (HvARH1), Hordeum vulgare L. HVA1 gene (HvA1), Hordeum vulgare L. HvSRG6 gene for stress responsive gene protein 6 (HvSRG6), Hordeum vulgare L. AP2 transcriptional activator gene (HvDRF1) - eseteben olyan informativ polimorfizmusokat konvertaltunk at genetikai markerekke, melyek altal elkulonithetők a valoszinűsithetően funkcionalis allelvariansok. Tovabba ezek a konnyen detektalhato genetikai markerek hasznosithatok kapcsoltsagi terkepezesek soran illetve a markerekre alapozott szelekcioban. Kutatasaink tovabbi fontos eleme volt egy arpa genotipus torzskollekcio szarazsagra adott valaszreakcioinak jellemzese a morfologiai, fiziologiai es agronomiai parameterek monitorozasa utjan kontroll es stresszelt korulmenyek kozott Komplex Stressz Diagnosztikai Rendszer hasznalataval. Celul tűztuk ki tovabba a tesztelt genotipusok fenotipikus stressz parameterek es a szarazsagtűresben szerepet jatszo genjeloltek azonositott haplotipusainak osszetetele kozotti kapcsolatok feltarasat. Celunk volt ezen tulmenően egy, az arpa szarazsagtűrasenek jellemzesere hasznalhato alapvető metodika kialakitasa a fenotipusos es haplotipusos eredmenyek egyuttes kiertekelese utjan. A szarazsagtolerancia mertekenek es tovabbi fontos agronomiai tulajdonsagok Komplex Stressz Diagnosztikai Rendszerben tortenő tesztelese erdekeben osszeallitottunk egy 23 genotipust tartalmazo arpa torzskollekciot. A morfologiai es fiziologiai tulajdonsagok monitorozasat kontroll (60 %-os vizellatottsag a teljes tenyeszidő alatt) es stressz (20 %) korulmenyek kozott kulonboző kepalkoto eljarasok alkalmazasaval vegeztuk. A morfologiai, fiziologiai tulajdonsagok, illetve a szarazsagtűressel osszefuggesbe hozhato agronomiai parameterek vizsgalatat tobbek kozott digitalis fenykepezes, illetve hőkameras levelhőmerseklet meghatarozas alkalmazasaval egy fel-automata fenotipizalasra alkalmas eszkoz, a Komplex Stressz Diagnosztikai Rendszer hasznalataval vegeztuk el. Vizsgalataink soran jelentős mertekű korrelaciot talaltunk a vizsgalt genotipusok termesmennyisege illetve tovabbi fontos agronomiai parameterei kozott, mint peldaul a harvest index, a vizhasznosito kepesseg es az ezerszemsuly. Ezen eredmenyek a Komplex Stressz Diagnosztikai Rendszer hasznalatabol fakado előnyokre hivhatjak fel a figyelmet. A hőkameras meresek alkalmaval a szarazsag stressznek kitett novenyek eseteben magasabb levelhőmersekleti ertekeket detektaltunk. A kivalasztott genotipusok eseteben a mert levelhőmerseklet es a pixel alapu zoldfelulet kozott kapcsolatot lehetett kimutatni. A meghatarozott pixel alapu zoldfelulet alapjan a genotipusokat stressz reakciojuk szerint tolerans es szenzitiv kategoriakba soroltuk az csokkenes 45 %-os erteket elkulonitő szintkent valasztva. Az analizis soran a tolerans es a szenzitiv kategoriakba tartozo genotipusok haplotipus osszeteteleben jelentős kulonbsegeket talaltunk a HvA1 gen eseteben. A genotipusokat termesstabilitasuk szerinti rangsor alapjan szinten tolerans es a szenzitiv kategoriakba soroltuk a termeskieses 55 %-os erteket kuszobszintkent veve alapul. A tolerans, illetve szenzitiv genotipusok haplotipus osszetetelet osszehasonlitva a HvDRF1 es a HvNHX1 gen eseteben lenyeges eltereseket talaltunk. A haplotipusok es a fenotipusos parameterek t-teszten alapulo asszociacios vizsgalata soran az arpa patogen gombak altal indukalt feherjejet kodolo gen (HvPPRPX) B-haplotipusa valamint a harvest index, az ezerszemsuly, a vizhasznositasi hatekonysag es a szemtermes kozott pozitiv osszefuggest tartunk fel. A kiserleteink eredmenyekent rendelkezesre allo fenotipus es haplotipus informaciokat tartalmazo adatsorok fontos kiindulasi pontjai lehetnek a szarazsagtűresben fontos szereppel rendelkező genvariansok QTL illetve asszociacios vizsgalatokkal tortenő azonositasa soran.

Genomikai és fenomikai megközelítések kombinálása az árpa szárazságtűrésének jellemzésében