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[ES] Uno de los mayores problemas para el desarrollo de estrategias efectivas frente a hongos fitopatogenos es que, al igual que la mayoria de los microorganismos, presentan una gran plasticidad fenotipica y una extraordinaria capacidad de adaptarse a nuevos ambientes y/o de infectar nuevos huespedes. En este contexto, resulta imprescindible determinar que genes (u otras regiones del genoma) muestran evidencias de evolucion adaptativa con el objetivo de identificar secuencias involucradas en virulencia. La evolucion adaptativa puede ser descripta como la retencion de cambios en el genoma que, de alguna manera, confieren ventajas adaptativas los individuos que los poseen. Las evidencias de evolucion adaptativa pueden ser de distintos tipos: seleccion positiva actuando en secuencias homologas, ganancia y perdida de genes y/o reordenaciones estructurales en el genoma.Entre las enfermedades vegetales causadas por los hongos, la antracnosis es una de las mas destructivas, causando perdidas significativas en cultivos en los cinco continentes. Los agentes etiologicos mejor conocidos de la enfermedad son ciertas especies del hongo filamentoso Colletotrichum, que infecta practicamente todas las familias de plantas de interes agronomico u horticola, con la consecuencia de perdidas economicas significativas. Ademas, los hongos del genero Colletotrichum representan importantes modelos experimentales en estudios relacionados con diversos aspectos de la fitopatologia, como ser enzimas degradadoras de carbohidratos, procesos infectivos, resistencia del hospedador y biologia molecular de las interacciones planta-patogeno. Muchas de las especies del genero Colletotrichum presentan una forma de nutricion denominada hemibiotrofia, por lo que exhiben caracteristicas tanto biotroficas como necrotroficas. En la presente Tesis Doctoral se han utilizado numerosas aproximaciones bioinformaticas para atender a diversas hipotesis relativas a la evolucion y biologia molecular de la patogenicidad en hongos filamentosos, haciendo hincapie en el patosistema C. graminicola-maiz. Para esto, nos hemos basado en el analisis de los genomas de ocho cepas de C. graminicola, una de ellas la recientemente secuenciada M1.001 y las restantes siete resecuenciadas por nuestro grupo. En el primer capitulo de la Tesis (Chapter I) se describen los procedimientos llevados a cabo para la secuenciacion, ensamblaje y anotacion de los nuevos genomas, como asi tambien las caracteristicas fenotipicas de dichos aislados. Por otra parte, por medio de analisis de los genomas, se presentan resultados concernientes a cuatro aspectos fundamentales de la genomica comparada de estos organismos: recombinacion, relaciones filogeneticas, variaciones estructurales del genoma y ganancia-perdida de genes. En el segundo capitulo (Chapter II) se analizan los patrones de seleccion natural actuando sobre secuencias codificantes y no codificantes de proteinas a nivel de todo el genoma. En el tercer capitulo (Chapter III) se detallan los resultados de la aplicacion de una metodologia…

Estudio de la evolución de un fitopatógeno: Genómica comparada del hongo patógeno de maíz Colletotrichum graminicola