English (United Kingdom)

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/featured_content/oa?rat=en

https://curated-unify.zendy.io/wp-json/zendy-region/v1/highlighted_journal/

Global: Zendy Tools annual

Presents the keyphrase highlighting as premium feature

Keyphrase Highlighting

Presents the summarisation as premium feature

Summarisation

Insights

Presents the pdf analysis as premium feature

PDF Analysis

Presents the zaia usage as premium feature

ZAIA

Global: Zendy Tools monthly

Global: Zendy Plus monthly

Presents the access of premium content as premium feature

Premium Content

Global: Zendy Plus annual

Global: Zendy Free Plan

[EN] In the last years, various genotyping techniques were developed for isolation of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) that has demonstrated a high discriminatory power. In this study, after the identification of selected strains at level of species by Genotype MTBC technique, we evaluated the profit of the simplified amplified-fragment Length Polymorphism technique (AFLPs) and the Mycobacterial Interspersed Repetitive Units technique (MIRU-15). A total of 131 mycobacterium tuberculosis isolates were analyzed, 68 isolates were collected in Ecuador, from the Clinical Laboratory of Hospital Alli Causai located in city of Ambato, and the Laboratory of Bacteriology in Carlos Andrade Marin Hospital located in the capital city Quito. The remaining 63 isolates were harvested in Spain and belong to microorganism's collection of Microbiology Services of Consorcio Hospital General Universitario and Hospital Clinico Universitario of the city of Valencia. Among these isolates, 126 were identified by conventional methods such as molecular MTBC, corresponding to 106 patients. The Mycobacterium tuberculosis control strain ATCC 25177 was also identified as such by this method. The AFLPs technique allowed as to group the strains in twelve patterns (P1 to P8, P10, P12, P13, P14), of which the most prevalent were patterns P1 with 77 (61.1%) and P2 with 27 (21, 4%) isolates, representing 82.5% of the same. These were followed by the pattern P5 with 5 (3.9%) isolates, the patterns P3, P4 and P6 grouped 3 isolates each one (2.4%), the patterns P8 and P12 with 2 isolates (1.6% ) and finally the patterns P7, P10, P13 and P14 with 1 isolated each one (0.8%). The control strain M. tuberculosis ATCC 25177, showed a restriction profile that prevented their inclusion in any of the patterns described. The discriminatory power of the Hunter-Gaston discriminatory index (HGDI) method was 0.5812 against to 0.9843 of the MIRU-15 technique, which grouped 69 strains (54.8%) in 20 clonal complex and 57 unique patterns (45.2%). In the case of Spain, the strains were related mostly to the lineage 4 or Euro-American including: Cammeroon (1.59%), Haarlem (36.51%), S (31.75%), and LAM (19.05%); the lineage 6 or West Africa I (9.53%), the lineage 1 or EIA (1.59%) In the case of Ecuador the strains were related to the lineage 4: Haarlem (42.86%), S (33.33%) and LAM (22.22%) and Beijing lineage 2 (1.59%) from Asia. The MIRU-VNTR Variable-Number Tandem Repeats (15 loci) technique proved to be a stable system, reproducible and high discriminatory power in comparison with AFLPs system, allowing the use of it to conduct prospective population studies with the aim of contributing to the public health programs to control Tuberculosis (TB). [ES] En los ultimos anos se han desarrollado diversas tecnicas de genotipificacion para aislados de Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) que han demostrado tener un alto poder discriminatorio. En este estudio, tras identificacion de las cepas seleccionadas al nivel de especie mediante la tecnica comercial GenoType MTBC, se ha evaluado la utilidad de la tecnica simplificada del Polimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificados (AFLPs) y la tecnica de Unidades Repetitivas Intercaladas Micobacterianas (MIRU-15). Se analizaron un total de 131 aislados clinicos de los cuales 68 aislados fueron recolectados en Ecuador, provenientes tanto del Laboratorio Clinico del Hospital Alli Causai ubicado en la ciudad de Ambato, provincia de Tungurahua como del Laboratorio de Bacteriologia del Hospital Carlos Andrade Marin ubicado en la ciudad capital Quito, provincia de Pichincha. Los 63 aislados restantes fueron recolectados en Espana y pertenecian coleccion de microorganismos de los Servicios de Microbiologia del Consorcio Hospital General Universitario y Hospital Clinico Universitario de la ciudad de Valencia, provincia de Valencia. De estos aislados, 126 fueron identificados por metodos convencionales y moleculares como MTBC, correspondientes a 106 pacientes. La cepa control Mycobacterium tuberculosis ATCC 25177 tambien fue identificada como tal mediante este metodo. La tecnica AFLPs permitio agrupar a las cepas en doce patrones (P1 a P8, P10, P12, P13, P14), de los cuales los mas prevalentes fueron los patrones P1 y P2 con 77 (61,1%) y 27 (21,4%) aislados respectivamente, lo que supone el 82,5% del total de los mismos. Le siguieron en frecuencia el patron P5 con 5 (3,9%) aislados, los patrones P3, P4 y P6 agruparon a 3 aislados cada uno (2,4%), los patrones P8 y P12 con 2 aislados (1,6%) y finalmente los patrones P7, P10, P13 y P14 con 1 aislado cada uno (0,8%). La cepa control M. tuberculosis ATCC 25177, mostro un perfil de restriccion que no permitio su inclusion en ninguno de los patrones descritos. El poder discriminatorio del metodo (HGDI) fue de 0,5812 frente a 0.9843 de la tecnica MIRU-15, que agrupo a 69 cepas (54,8%) en 20 complejos clonales y 57 patrones unicos (45,2%). Para el caso de Espana, las cepas estuvieron relacionadas en su mayoria con el linaje 4 o Euro-Americano que incluye: Cammeroon (1,59%), Haarlem (36,51%), S (31,75%), y LAM (19,05%); el linaje 6 o West Africa I (9,53%), el linaje 1 o EIA (1,59%), Para el caso de Ecuador las cepas estaban relacionadas con el linaje 4: Haarlem (42,86%), S (33,33%), y LAM (22,22%) y el linaje 2 Beijing (1,59%) originario de Asia. La tecnica MIRU-VNTR (15 loci) demostro ser un sistema estable, reproducible y con un poder discriminatorio alto en comparacion con AFLPs lo que permitiria emplearlo para realizar estudios poblacionales prospectivos con la finalidad de contribuir a los programas de Salud Publica para el control de la Tuberculosis (TB). [CAT] En els ultims anys s'han desenvolupat diverses tecniques de genotipificacio per aillats de Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) que han demostrat tenir un alt poder discriminatori. En aquest estudi, despres de la identificacio de les soques seleccionades al nivell d'especie mitjancant la tecnica comercial GenoType MTBC, s'ha avaluat la utilitat de la tecnica simplificada del Polimorfisme de longitud de fragments amplificats (AFLPs) i la tecnica d'Unitats repetitives Intercalades micobacterianes (Miru-15). Es van analitzar un total de 131 aillats clinics dels quals 68 aillats van ser recollectats a Equador, provinents tant del Laboratori Clinic de l'Hospital Alli Causai situat a la ciutat d'Ambato, provincia de Tungurahua com del Laboratori de Bacteriologia de l'Hospital Carlos Andrade Marin ubicat a la ciutat cabdal Quito, provincia de Pichincha. Els 63 aillats restants van ser recollectats a Espanya i pertanyien a la colleccio de microorganismes dels Serveis de Microbiologia del Consorci Hospital General Universitari i Hospital Clinic Universitari de la ciutat de Valencia, provincia de Valencia. D'aquests aillats, 126 van ser identificats per metodes convencionals i moleculars com MTBC, corresponents a 106 pacients. La soca control Mycobacterium tuberculosi ATCC 25177 tambe va ser identificada com a tal mitjancant aquest metode. La tecnica AFLPs va permetre agrupar les soques en dotze patrons (P1 a P8, P10, P12, P13, P14), dels quals els mes prevalents van ser els patrons P1 i P2 amb 77 (61,1%) i 27 (21, 4%) aillats respectivament, fet que suposa el 82,5% del total dels mateixos. El van seguir en frequencia el patro P5 amb 5 (3,9%) aillats, els patrons P3, P4 i P6 van agrupar a 3 aillats cadascun (2,4%), els patrons P8 i P12 amb 2 aillats (1,6%) i finalment els patrons P7, P10, P13 i P14 amb 1 aillat cadascun (0,8%). La soca control M. tuberculosis ATCC 25177, va mostrar un perfil de restriccio que no va permetre la seva inclusio en cap dels patrons descrits. El poder discriminatori del metode (HGDI) va ser de 0,5812 enfront de 0,9843 de la tecnica MIRU-15, que va agrupar a 69 soques (54,8%) en 20 complexos clonals i 57 patrons unics (45,2%). Per al cas d'Espanya, les soques van estar relacionades majoritariament amb el llinatge 4 o Euro-America que inclou: Cammeroon (1,59%), Haarlem (36,51%), S (31,75%), i LAM (19,05%); el llinatge 6 o West Africa I (9,53%), el llinatge 1 o EIA (1,59%), Pel cas de l'Equador les soques estaven relacionades amb el llinatge 4: Haarlem (42,86%), S ( 33,33%), i LAM (22,22%) i el llinatge 2 Beijing (1,59%) originari d'Asia. La tecnica Miru-VNTR (15 loci) va demostrar ser un sistema estable, reproduible i amb un poder discriminatori alt en comparacio amb AFLPs, el que permetria emprar-lo per realitzar estudis poblacionals prospectius amb la finalitat de contribuir als programes de salut publica per al control de la Tuberculosi (TB).

Genotipificación de Mycobacterium tuberculosis complex mediante herramientas moleculares