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Abstract – Individual milk samples taken from goats of the Skopelos breed of Greece were analyzed by RP-HPLC using as standards the casein fraction of milks of known genotypes. Milk samples with particular characteristics with respect to the casein fraction were further analyzed by IEF and RP-HPLC/ESI-MS. The mean total protein content (36.7 ± 2.6 g·L–1) and the mean casein content (29.7 ± 2.3 g·L–1) were high. The same was true for the αs1-cn fraction, which was 21.8% of the total cn fraction, whereas the β-cn percentage of total cn was 43.8%. The respective values for αs2- cn and κ-cn were 13.7% and 13.8%. These quantitative characteristics were consistent with the predominance of the strong αs1-cn variants B3, B4 and As/B1. In all samples analyzed by RP-HPLC/ ESI-MS the deleted form differing from the respective complete form by Gln78 was found at different levels of phosphorylation, with the exception of variants F and D/G. The most frequent αs2-cn variant was by far variant A followed by variants C and F, whereas compositional data implied the existence of a null allele. The detected β-cn forms were variants A and C in similar frequencies. Variant D (formerly B) of κ-cn predominated and the rare variant G was found. Different phosphorylation types of each casein variant and the characteristics of whey proteins were also determined.Des laits individuels de chèvres de Skopelos (Grèce) ont été analysés par RP-HPLC et les profils protéiques ont été comparés avec ceux issus de lait de chèvres de génotypes connus au locus as1. Les échantillons qui présentaient des caractéristiques particulières de leur fraction caséique ont été analysés par IEF et RP-HPLC/ESI-MS. Les teneurs moyennes en protéines totales (36,7 ± 2,6 g·L-1), et en caséines (29,7 ± 2,3 g·L-1), étaient plus élevées que dans les laits des races hautement sélectionnées. Le pourcentage en as1-cn représentait 21,8 % des caséines totales, tandis que celui de la b-cn atteignait 43,8 %. Les pourcentages en as2-cn et k-cn étaient respectivement 13,7 % et 13,8 %. Ces caractéristiques quantitatives étaient corrélées avec la prédominance des variants forts B3, B4 et As/B1 de la as1-cn. Dans tous les échantillons analysés par RP-HPLC/ESI-MS, la forme déplétée en Gln78 de la as1-cn présentait plusieurs niveaux de phosphorylation, à l'exception des variants F et D/G. Le variant le plus abondant de la as2-cn était le variant A suivi par les variants C et F. Les variants A et C de la b-cn ont été trouvés en fréquences similaires. Le variant D (antérieurement dénommé B) de la k-cn était prédominant bien que le variant rare G était aussi trouvé. Plusieurs niveaux de phosphorylation de chacun de ces variants ont été aussi mis en évidence, ainsi que les principales caractéristiques des protéines du séru

Protein composition and polymorphism in the milk of Skopelos goats