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L'activite d'une proteine est liee non seulement a sa structure, mais egalement a sa dynamique, et il est important de connaitre la nature de ses mouvements pour comprendre sa fonction biologique. La resonance magnetique nucleaire est particulierement utile pour etudier la dynamique d'une molecule en solution sur une gamme de temps de correlation tres large. En particuliere, la relaxation des spins 15 N ou 13 C donne acces aux mouvements moleculaires avec les temps caracteristiques entre les dizaines de picosecondes et le temps de correlation rotationelle de la molecule (autour de 10ns pour une proteine monomerique de 20 kD a 300 K). Les vitesses de relaxation dependent de la flexibilite de chaque site, et peuvent etre caracterise en termes d'amplitude et de temps caracteristique locale. La precision de ces parametres et sa comprehension en termes de fonction exigent que la reorientation globale de la molecule soit correctement prise en compte. Ces methodes experimentales, qui seront presentees ici brievement, font maintenant partie de la panoplie d'experiences appliquees dans l'etude de la relation structure-dynamique d'une proteine et ses partenaires. Neanmoins les mouvements plus lents, entre la nano et la milliseconde, sont plus difficiles a etudier, et il y a tres peu d'information disponible sur la nature de la dynamique de la chaine peptidique dans cette gamme de temps par RMN. Tres recemment de nouvelles methodologies ont ete proposees, basees sur l'alignement preferentiel d'une proteine par rapport au champ magnetique, induit par dissolution de la molecule dans un cristal liquide tres dilue. Dans ces conditions les changements conformationels sur des temps caracteristique plus lents (jusqu'au millisecondes) peuvent etre etudies. Nous presenterons cette technique, et quelques resultats, comparant la dynamique rapide (ps-ns), et plus lente le long de la chaine peptidique de quatre proteines.

Modélisation de la dynamique de la chaîne peptidique des protéines en solution par RMN à travers les couplages dipolaires