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La Directive Cadre Europeenne sur I'Eau fixe, a l'horizon 2015, un objectif de "bon etat ecologique" avec obligation de resultat pour tous les milieux aquatiques naturels. Nous examinons les besoins de recherche dans le domaine des concepts, des methodes de diagnostic et des modeles prospectifs. Les cours d'eaux sont caracterises par leur dynamique liee a des processus physiques, chimiques et biologiques qui permettent une certaine reversibilite des perturbations anthropiques. Les indicateurs devraient mettre l'accent sur l'alteration des processus. Le bon etat se definit comme un ecart "leger" a une situation de reference naturelle, mesure principalement sur des bioindicateurs. Une typologie par hydro-ecoregions permet d'identifier des regions homogenes en termes de processus ecologiques dominants. Les references seront cherchees dans des bassins ou I'anthropisation n'a pas altere ces processus fondamentaux. Les bioindicateurs devront etre regionalises, harmonises et inter etalonnes, et de nouvelles metriques (traits biologiques, indices de structure) sont a rechercher. Le diagnostic doit aussi orienter l'action, en hierarchisant les causes d'alteration. Des modeles permettant de prevoir l'efficacite des actions de restauration en terme de reponses biologiques seront necessaires dans les domaines suivants : morpho-dynamique, relation habitat peuplements, transfert des polluants, devenir de la matiere organique, ecotoxicologie, et reponses biologiques complexes tenant compte des interactions entre differents impacts en fonction du contexte naturel.

Les questions de recherche posées par la Directive Cadre Européenne sur I'Eau : problématique pour les eaux de surface continentales